冠军揭晓！2024『猛犸杯』国际生命科学数据创新大赛-欧洲·算法赛圆满落幕

2024年6月19日,由深圳国家基因库、华大生命科学研究院、国际数据委员会共同发起,华大基因和华大智造主办的2024『猛犸杯』国际生命科学数据创新大赛-欧洲·算法赛(2024  MICOS-EU)决赛在塞尔维亚贝尔格莱德顺利举办。

经过初赛、复赛的严格评审筛选,6支队伍从100多个参赛团队中脱颖而出进入最后决战。经过激烈角逐决出最终结果:来自苏黎世联邦理工学院的“Curious”团队荣获一等奖,另外5支来自University of Belgrade、IDATA、University of Kragujevac、SynBio AI  Lab和重庆科技大学等机构的团队分别荣获二、三等奖和优秀奖。

上图:冠军颁奖

2024  MICOS-EU聚焦科研热点时空组,旨在有效解决空间转录组数据聚类算法的准确性和效率问题。自今年4月正式启动以来,共吸引来自中国、瑞士、塞尔维亚、新加坡、丹麦、西班牙等国家和地区的100余支团队参与。

6月19日,2024  MICOS-EU决赛与贝尔格莱德生物信息学会议(BelBi2024)在塞尔维亚贝尔格莱德同期举行。贝尔格莱德大学、塞尔维亚分子遗传学与基因工程研究所、Ana  and Vlade Divac Foundation和华大教育中心等机构的专家作为嘉宾/评委莅临现场参与本次决赛。

晋级团队 终极PK

2024  MICOS-EU决赛于6月19日顺利举行,华大生命科学研究院院长徐讯以线上视频的形式为本次决赛致辞。徐讯院长表示:“我们很高兴将MICOS带到欧洲,这是MICOS大赛的一个重要里程碑。  期待决赛中创新算法的涌现,为空间转录组学数据处理提供突破性解决方案,进一步推动多组学数据研究的进步!”

在答辩环节,进入决赛的6支团队分别对各自的算法/模型展开精彩介绍。每支参赛团队陈述结束后,评委专家进行提问,随后从算法/模型创新性、架构设计、复杂度以及答辩过程的PPT陈述、逻辑性等方面进行评分。

本次大赛的最终评分由线上得分和答辩得分两部分组成,按二者加权后的最终得分进行排名。经过激烈的角逐,本次大赛的结果正式揭晓:

冠军团队开发的AESTETIK算法为空间转录组学研究产生的海量多模态数据中的聚类问题提供了卓越的解决方案,尤其是在解决异质细胞群癌症组织研究等精准医疗挑战中表现出色。

AESTETIK是一种卷积深度学习模型算法,整合了空间转录组学研究涉及的多种数据类型:转录组数据、空间位置、组织形态等,并基于10x  Genomics、NanoString、Stereo-seq等多个技术平台产生的数据集进行性能优化和提升,在下游分析任务中取得了优异的成绩,性能和效果远超其他已知算法。

上图:决赛现场

至此2024 MICOS-EU圆满收官。作为MICOS大赛的首个海外赛道,2024  MICOS-EU获奖的6支优秀参赛团队根据时空转录组数据集分析任务目标,提出了6种不同的聚类算法思路并进行了改进,为时空组多模态数据分析提供突破性解决方案。

2024 MICOS-EU赛事组织机构

发起单位:深圳国家基因库、华大生命科学研究院、国际数据委员会

主办单位:华大基因、华大智造

协办单位:贝尔格莱德大学电气工程学院、塞尔维亚分子遗传学与基因工程研究所

赞助单位:华讯网络、深圳市蓝色亿点科技有限公司

*大赛组委会保留对本次大赛的最终解释权。